牛、羊糞中不僅含有豐富的營(yíng)養(yǎng)成分，也含有部分有害物質(zhì)。未經(jīng)處理的牛糞中含有馬尿酸等物質(zhì)，馬尿酸對(duì)植物的根系有害，未經(jīng)發(fā)酵腐熟的肥料投入到農(nóng)業(yè)中，將消耗作物根際土壤中的氧和燒傷作物根系。

有機(jī)肥發(fā)酵腐熟基本指標(biāo)：
1、 松散度  生物發(fā)酵法從發(fā)酵的第四天開(kāi)始松散，呈碎末狀。
2、 氣味  生物發(fā)酵法從第2天開(kāi)始臭味減輕，第4天基本消失，第5天消失，第7天散發(fā)泥土的清香。
3、 溫度  生物發(fā)酵法第2天達(dá)到高溫階段，到7天開(kāi)始回落。保持較長(zhǎng)時(shí)間的高溫階段，發(fā)酵腐熟。
4、 PH值  生物發(fā)酵法PH值達(dá)到6.5。
5、 含水率  發(fā)酵原料初始含水率55%，生物發(fā)酵法含水率可降到30%。
6、 銨態(tài)氮（NH4+-N）  發(fā)酵開(kāi)始時(shí)，銨態(tài)氮的含量迅速增加，在第4天時(shí)達(dá)到 量，這是因?yàn)榘被饔靡约坝袡C(jī)氮的礦化作用引起的，隨后堆肥中的銨態(tài)氮由于揮發(fā)損失及轉(zhuǎn)化成為硝態(tài)氮而逐漸減少。當(dāng)銨態(tài)氮小于400mg/kg達(dá)到腐熟標(biāo)志。生物發(fā)酵法銨態(tài)氮含量可降低到215mg/kg左右。
7、 碳氮比  堆肥碳氮C/N比達(dá)到20以下，就達(dá)到腐熟指標(biāo)。
8、 大腸桿菌數(shù)和蛔蟲(chóng)卵死亡率。
    糞大腸菌群數(shù)≤ 100個(gè)/克（mL）
    蛔蟲(chóng)卵死亡率≥ 95%
9、 種子發(fā)芽率  生物法發(fā)酵法發(fā)酵的牛、羊糞發(fā)芽率達(dá)到80%以上。